选择马拉松速度意味着所有生产、科研和军事行动都会变得异常漫长，总回合数达到标准模式的三倍。这种模式下每一个时代都相当于标准速度的一整局游戏，需要更注重长期规划和细节把控。开局阶段必须优先保证基本生存能力，侦察单位不要贸然探索未知区域，早期遭遇野蛮人或敌对文明的突袭可能导致主力部队损失，而补充单位需要消耗大量时间。第一个开拓者应选择资源丰富且易守难攻的地块建立主城，粮食和生产力均衡的区域能支撑后续发展。
初始建造顺序推荐先造投石兵或勇士，确保主城防御之后再出建造者改良资源。农业、采矿和制陶术这类能直接提升资源获取效率的科技应当优先研发，文化方面则推荐先解锁国家劳动力这类增强生产力的政策。早期征服其他文明的代价极高，一旦主力部队被歼灭，重建军队的周期会让自身陷入被动，每座城市至少需要保证3人口才能解锁区域建造资格，所以粮食储备至关重要。
建造者改良地块时优先开发粮食资源，其次是生产力地块，当城市人口达到5以上时，可考虑修建商业中心或工业区提升资源流转效率。马拉松模式下建造奇观通常需要80到100回合，必须确保城市在此期间不受战争干扰且生产力充足。中后期重点转向差异化胜利路线，文化胜利需要提前规划剧院广场布局并持续产出伟人，科技胜利则依赖学院区的密集建设。马拉松模式的核心在于节奏控制，开拓者选址需预留区域扩展空间，科技研发需配合时代进程。
