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Primer Premier: 专业PCR与转录组测序引物设计软件

Primer Premier 是一款由澳大利亚 Premier 企业开发的专业软件，广泛应用于PCR和转录组测序引物以及探针的设计。该软件的主要功能包括引物设计、限制性内切酶位点分析、DNA 基元搜索和同源性分析，其中前三种功能尤为关键。另外软件还具备一些独特功能，例如设计简并引物、编码序列阅读、DNA 与蛋白质编码序列的转换以及语音播报等。

软件特点

Primer Premier 软件支持根据模板DNA的来源选择相应的遗传密码标准，以转换DNA和氨基酸序列。软件提供了八种微生物亚结构的遗传密码标准供用户选择，包括：

纤毛虫大核（Ciliate Macronuclear）

节肢动物线粒体（Invertebrate Mitochondrion）

衣原体（Mycoplasma）

绿色植物线粒体（Plant Mitochondrion）

腔肠动物线粒体（Protozoan Mitochondrion）

一般标准（Standard）

哺乳动物线粒体（Vertebrate Mitochondrion）

酵母菌线粒体（Yeast Mitochondrion）

如何使用

安装 Primer Premier 6.0：运行安装程序 Primer Premier 6.0 Installer.exe。

更换文件：将 C:\Program Files\Primer Premier 6.0\http\P80\DMIUpdater\DMPP\DM600 目录下的 RMToolkit.jar 文件替换为更新的版本。

更改安装路径：如果更改了安装路径，请按照新的路径找到 RMToolkit.jar 文件并进行替换。

软件功能

主要界面：软件界面主要分为四大块，包括编码序列编写对话框（Genetank）、引物设计对话框（Primer Design）、酶切分析对话框（Restriction Sites）和纹基分析对话框（Motif）。

引物设计：软件用于引物设计，用户可以简单地通过鼠标拖拽来选择所需的引物片段。

引物检索与参数分析：在手动操作过程中，软件会显示各种参数的更改和可能的二聚体、异二聚体、发夹结构等。用户还可以设置标准，让软件自动检索引物，并将引物分析数据显示出来。

易用性：Primer Premier 软件操作简单，已被引物设计领域的专业人员认为是一款非常优秀的软件。